RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RNF139Q8WU17 664 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SLC39A13Q96H72 371 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ZWILCHQ9H900 591 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CLDND1Q9NY35 253 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 DPP7Q9UHL4 492 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 AMFRQ9UKV5 643 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 USP18Q9UMW8 372 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SLC12A8A0AV02 714 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 GREM1O60565 184 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SRGAP2O75044 1071 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RNF8O76064 485 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 PRAMEF12O95522 483 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 KLKB1P03952 638 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 HMBSP08397 361 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CD48P09326 243 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RARAP10276 462 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CTNNA2P26232 953 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CXCR5P32302 372 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 PPP3CCP48454 512 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ARSEP51690 589 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 ACAP1Q15027 740 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 LLGL1Q15334 1064 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CLUL1Q15846 466 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 GPR158Q5T848 1215 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 COG1Q8WTW3 980 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RAPGEF5Q92565 580 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 PIDD1Q9HB75 910 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 GKN1Q9NS71 199 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 RRN3Q9NYV6 651 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 FZD10Q9ULW2 581 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 SNX12Q9UMY4 172 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 CCL26Q9Y258 94 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 C5orf42Q9H799 3197 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-216ENST00000549221 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CCDC66A2RUB6 948 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CTAGE9A4FU28 777 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 FAM72CH0Y354 149 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ZNF185O15231 689 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PSTPIP1O43586 416 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PRPSAP2O60256 369 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 STC2O76061 302 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 IRF1P10914 325 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PYGMP11217 842 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 HDCP19113 662 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 CASQ1P31415 396 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ADRA1BP35368 520 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 TBX4P57082 545 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 SLC7A9P82251 487 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 MMRN1Q13201 1228 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 NNTQ13423 1086 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 RPS6KA1Q15418 735 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 LRRC38Q5VT99 294 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-216ENST00000549221 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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