RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549030.1

PACS2-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene PACS2, Length 1,925 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-209ENST00000549030 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 SAMD11Q96NU1 681 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CALN1Q9BXU9 219 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 FZD10Q9ULW2 581 aa21.43■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 MYO9BQ13459 2157 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ESYT3A0FGR9 886 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 IRAK2O43187 625 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 GLUD1P00367 558 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CLCN4P51793 760 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 DPYSL3Q14195 570 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CYP1B1Q16678 543 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 RNF139Q8WU17 664 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 15.8
PACS2-209ENST00000549030 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.42■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 EPOPA6NHQ4 379 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PHF2O75151 1096 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 C8AP07357 584 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 KRT222Q8N1A0 295 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 MYRFLQ96LU7 910 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 MAFFQ9ULX9 164 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TTI1O43156 1089 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 L1CAMP32004 1257 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CXCR3P49682 368 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 COPS2P61201 443 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 EFEMP1Q12805 493 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 KRT81Q14533 505 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 VEPH1Q14D04 833 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TAZQ16635 292 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 EMBQ6PCB8 327 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PSMG2Q969U7 264 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 MSRAQ9UJ68 235 aa21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PER2O15055 1255 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 IL4RP24394 825 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 CHRNA3P32297 505 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PTPN7P35236 360 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 EPHB3P54753 998 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TRADDQ15628 312 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TAF12Q16514 161 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 DPYSL2Q16555 572 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 SEC14L1Q92503 715 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.4■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 EPCAMP16422 314 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ADRA1BP35368 520 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 PSEN1P49768 467 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 RAB30Q15771 203 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 FAM71BQ8TC56 605 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 IFT81Q8WYA0 676 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 NFU1Q9UMS0 254 aa21.39■■□□□ 1.02
PACS2-209ENST00000549030 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 LPXNO60711 386 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 F9P00740 461 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 GGCXP38435 758 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 DYNLT1P63172 113 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 TDHQ8IZJ6 230 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.013e-8■■■■■ 52.7
PACS2-209ENST00000549030 CAVIN3Q969G5 261 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 NTAN1Q96AB6 310 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 HAUS1Q96CS2 278 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 WDCPQ9H6R7 721 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.39■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 TLR5O60602 858 aa21.38■■□□□ 1.01
PACS2-209ENST00000549030 LRG1P02750 347 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms