RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542838.5

DDX11-223, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX11, Length 3,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-223	ENST00000542838	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PDE5A	O76074	875 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	GSR	P00390	522 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	GRIA1	P42261	906 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	MAGEA3	P43357	314 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	USP6NL	Q92738	828 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	OPHN1	O60890	802 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PROC	P04070	461 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PROZ	P22891	400 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	MED21	Q13503	144 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SIN3B	O75182	1162 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CNTF	P26441	200 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	RGS7	P49802	495 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CCNI	Q14094	377 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	DBN1	Q16643	649 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	EMCN	Q9ULC0	261 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	GLRA3	O75311	464 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	IL18RAP	O95256	599 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	TPSB2	P20231	275 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	ADORA2A	P29274	412 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	L1CAM	P32004	1257 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PRKG1	Q13976	671 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	CDT1	Q9H211	546 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX11-223	ENST00000542838		A0A1B0GVG6	124 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	ACKR2	O00590	384 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	TPP1	O14773	563 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	GJB1	P08034	283 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	UQCRB	P14927	111 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	PTPRA	P18433	802 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	CYP3A5	P20815	502 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	AQP4	P55087	323 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	PLIN3	O60664	434 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	GCAT	O75600	419 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	CYP2F1	P24903	491 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	SERPINB6	P35237	376 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	JADE3	Q92613	823 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	MIS12	Q9H081	205 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX11-223	ENST00000542838	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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