RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ILK	Q13418	452 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF234	Q14588	700 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP49	Q70CQ1	688 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	LGMN	Q99538	433 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	VILL	O15195	856 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSPAN3	O60637	253 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLSTN1	O94985	981 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	C6	P13671	934 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	IDE	P14735	1019 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRKCH	P24723	683 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATIC	P31939	592 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	DCLK3	Q9C098	648 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	WISP1	O95388	367 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNTT	P04053	509 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	GLDC	P23378	1020 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ACADVL	P49748	655 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CASP5	P51878	434 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLDN6	P56747	220 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q6ZNB5	142 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	EID2	Q8N6I1	236 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PHACTR2	O75167	634 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	RARG	P13631	454 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	TXLNA	P40222	546 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PGF	P49763	221 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PSEN1	P49768	467 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	COG7	P83436	770 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	GANC	Q8TET4	914 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	PANK4	Q9NVE7	773 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CBX4	O00257	560 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP26A1	O43174	497 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC28A2	O43868	658 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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