RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531524.5

BSCL2-223, Transcript of BSCL2, seipin lipid droplet biogenesis associated, human

TSL 3

Gene BSCL2, Length 844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BSCL2-223	ENST00000531524	ORC1	Q13415	861 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	TRPC3	Q13507	836 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	STARD3	Q14849	445 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	KIF19	Q2TAC6	998 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF699	Q32M78	642 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ACOT1	Q86TX2	421 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	C12orf29	Q8N999	325 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	RDH13	Q8NBN7	331 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	TMC2	Q8TDI7	906 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	IGSF8	Q969P0	613 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	LMLN	Q96KR4	655 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	TWNK	Q96RR1	684 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	NUP58	Q9BVL2	599 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	GPR174	Q9BXC1	333 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PANK2	Q9BZ23	570 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PRORY	Q9H606	182 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	MTMR6	Q9Y217	621 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	LRRK2	Q5S007	2527 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524		A0A1B0GVT2	93 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	MEI4	A8MW99	385 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	CLIC2	O15247	247 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	KLRC4	O43908	158 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PPP6R2	O75170	966 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	FAM200B	P0CF97	657 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	RARG	P13631	454 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ACSL1	P33121	698 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	CHKA	P35790	457 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	GRK6	P43250	576 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	MAP3K7CL	P57077	242 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	COG7	P83436	770 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	CYP4F3	Q08477	520 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF234	Q14588	700 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ARID5B	Q14865	1188 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	RTP5	Q14D33	572 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	E2F5	Q15329	346 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	SHB	Q15464	509 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	RAB41	Q5JT25	222 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	SV2A	Q7L0J3	742 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PDILT	Q8N807	584 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	IQUB	Q8NA54	791 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	OR2T3	Q8NH03	318 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	TSC1	Q92574	1164 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	COL26A1	Q96A83	441 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	MED10	Q9BTT4	135 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	DUSP16	Q9BY84	665 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	DCLK3	Q9C098	648 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	NACA2	Q9H009	215 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BSCL2-223	ENST00000531524	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.2	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms