RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 PIGZQ86VD9 579 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 DENND1CQ8IV53 801 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 GJB3O75712 270 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SYPP08247 313 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 GTF2H1P32780 548 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 CHKAP35790 457 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ENPP2Q13822 863 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 RAB41Q5JT25 222 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 CAMK1GQ96NX5 476 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 DCLK3Q9C098 648 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 DSPP15924 2871 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 LAMA5O15230 3695 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 KCNJ18B7U540 433 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 PRKCHP24723 683 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 GRIK2Q13002 908 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 CACUL1Q86Y37 369 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 FOXJ1Q92949 421 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 RAB20Q9NX57 234 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SUSD2Q9UGT4 822 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM131Q92545 1883 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC12A8A0AV02 714 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 MEI4A8MW99 385 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TULP2O00295 520 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TKTL1P51854 596 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF234Q14588 700 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR45BQ5MNZ6 344 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 CPXM2Q8N436 756 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TATDN2Q93075 761 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 GPR174Q9BXC1 333 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ULBP1Q9BZM6 244 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 MSRB2Q9Y3D2 182 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 NBEAQ8NFP9 2946 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 NPC1O15118 1278 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SH3BP5O60239 455 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 NCAM1P13591 858 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TPMTP51580 245 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 COPAP53621 1224 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM215Q68D42 235 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 TTC39CQ8N584 583 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 UCMAQ8WVF2 138 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 CIPCQ9C0C6 399 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 ITM2CQ9NQX7 267 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 NUMA1Q14980 2115 aa23.39■■□□□ 1.34
PACSIN3-207ENST00000530513 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 CYBBP04839 570 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 GNSP15586 552 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF132P52740 706 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 CBWD6Q4V339 395 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 DDI1Q8WTU0 396 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 DNASE2BQ8WZ79 361 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 PLD4Q96BZ4 506 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.39■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 PTPRBP23467 1997 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 ITPR1Q14643 2758 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-207ENST00000530513 A0A1W2PQ27 194 aa23.38■■□□□ 1.33
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