RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 HSD17B4P51659 736 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MAP2K6P52564 334 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CDC42EP1Q00587 391 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GRM7Q14831 915 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 WTAPQ15007 396 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.75□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 FIBPO43427 364 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 OFD1O75665 1012 aa4.74□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SHHQ15465 462 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MAN2A1Q16706 1144 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TTC22Q5TAA0 569 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.74□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 IFI44Q8TCB0 444 aa4.74□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 NT5C1BQ96P26 610 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 UIMC1Q96RL1 719 aa4.74□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.74□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 CEP72Q9P209 647 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RIPK3Q9Y572 518 aa4.74□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NRCAMQ92823 1304 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MCM3APO60318 1980 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0D9SFI3 127 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC69A6NI79 296 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PRC1O43663 620 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 B3GALT2O43825 422 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ITGA10O75578 1167 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TUSC2O75896 110 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 UBXN7O94888 489 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 REC8O95072 547 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CXCL10P02778 98 aa4.73□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 CALML3P27482 149 aa4.73□□□□□ -1.65
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HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 METTL7BQ6UX53 244 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NIPA1Q7RTP0 329 aa4.73□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.73□□□□□ -1.65
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