RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 DNASE1L3Q13609 305 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 BLMHQ13867 455 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTK2BQ14289 1009 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CEP78Q5JTW2 689 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 C16orf89Q6UX73 402 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAGEH1Q9H213 219 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPCSQ9HAB8 311 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAB21Q9UL25 225 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 FZD4Q9ULV1 537 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CA14Q9ULX7 337 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM232C9JQI7 657 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 DHHO43323 396 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACTL6BO94805 426 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRKCGP05129 697 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 THBS4P35443 961 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SERPINF1P36955 418 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARHGAP25P42331 645 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 AGTR2P50052 363 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 GAB1Q13480 694 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SEC23BQ15437 767 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 RANBP10Q6VN20 620 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CNGA4Q8IV77 575 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 MYCT1Q8N699 235 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 NPIPB3Q92617 1050 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 KAZALD1Q96I82 304 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 MECRQ9BV79 373 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 HMX3A6NHT5 357 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 BTBD19C9JJ37 291 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SYT5O00445 386 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 TCEA3O75764 348 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 RNF8O76064 485 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ITGA2BP08514 1039 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 MMP8P22894 467 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 NDUFS1P28331 727 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CD38P28907 300 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 YPEL5P62699 121 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 NHLH1Q02575 133 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CBFBQ13951 182 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CNGA3Q16281 694 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ANO1Q5XXA6 986 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ERAP2Q6P179 960 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACSM6Q6P461 480 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 VSTM1Q6UX27 236 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 RRAGAQ7L523 313 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRABD2AQ86V40 505 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 HMGB4Q8WW32 186 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 RTKNQ9BST9 563 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-685P-201ENST00000517088 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms