RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD101Q93033 1021 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF599Q96NL3 588 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTATIP2Q9BUP3 242 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf43Q9BWL3 253 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF696Q9H7X3 374 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 IFT22Q9H7X7 185 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXorf36Q9H7Y0 433 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 USP29Q9HBJ7 922 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FNIP2Q9P278 1114 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNX14Q9Y5W7 946 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 NCOR1O75376 2440 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 DPPA5A6NC42 116 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM172BPA6NC97 362 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM72CH0Y354 149 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 XPNPEP2O43895 674 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 LCATP04180 440 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 BPIP17213 487 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 AGXTP21549 392 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKAR1BP31321 381 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 CIITAP33076 1130 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 VIPR2P41587 438 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 JAK3P52333 1124 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC16A1P53985 500 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKAG1P54619 331 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRT17Q04695 432 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBL2Q08999 1139 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR18Q14330 331 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 MGAT5BQ3V5L5 792 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FSCBQ5H9T9 825 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMCO4Q5TGY1 634 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM72AQ5TYM5 149 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM72DQ6L9T8 149 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM72BQ86X60 149 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF280BQ86YH2 543 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 CADM3Q8N126 398 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAGSQ8N159 534 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 PNPLA1Q8N8W4 532 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 C3orf20Q8ND61 904 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM216AQ8WUB2 273 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM171Q8WVE6 324 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMED6Q8WW62 240 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 NINJ1Q92982 152 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPP2R3CQ969Q6 453 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 EME1Q96AY2 570 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 FIZ1Q96SL8 496 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATOH8Q96SQ7 321 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTC1Q99614 292 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDCPQ9H6R7 721 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 AAMDCQ9H7C9 122 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 KANSL2Q9H9L4 492 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM36Q9NQ86 728 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEMA5BQ9P283 1151 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 XPR1Q9UBH6 696 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 UTS2RQ9UKP6 389 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 POLHQ9Y253 713 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR81Q562E7 1941 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-287P-201ENST00000516230 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 MEIOCA2RUB1 952 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLHL33A6NCF5 533 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 UNCXA6NJT0 531 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 C16orf96A6NNT2 1141 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRAC2D3DTV9 90 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 P2RY10O00398 339 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CRYAAP02489 173 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCF3P15923 654 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 EPHA3P29320 983 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALDH4A1P30038 563 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ID4P47928 161 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 MTHFSP49914 203 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms