RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 NELL1Q92832 810 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 C5orf34Q96MH7 638 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 NELFAQ9H3P2 528 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SLAMF7Q9NQ25 335 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SIRT5Q9NXA8 310 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ETAA1Q9NY74 926 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF112Q9UJU3 913 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 CEP162Q5TB80 1403 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 TBKBP1A7MCY6 615 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 AGAP14A8MT82 685 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 H3BNC9 293 aa2.45□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SPTLC2O15270 562 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SEC14L2O76054 403 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 USP1O94782 785 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF28P17035 718 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 PSMA3P25788 255 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 EPHA3P29320 983 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 IL13P35225 146 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ADCY8P40145 1251 aa2.45□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 MRE11P49959 708 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 KCNQ1P51787 676 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 UBXN2BQ14CS0 331 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC24Q50LG9 513 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ODF2Q5BJF6 829 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 CRB2Q5IJ48 1285 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 CERCAMQ5T4B2 595 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 KRT40Q6A162 431 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF529Q6P280 563 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 FAM83AQ86UY5 434 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 TICAM1Q8IUC6 712 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 TNIP2Q8NFZ5 429 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 MDM1Q8TC05 714 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ATP6V1E2Q96A05 226 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 PGAM5Q96HS1 289 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA25Q9BR10 227 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 PTDSS2Q9BVG9 487 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 TEX12Q9BXU0 123 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 BRD8Q9H0E9 1235 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 OR10A4Q9H209 315 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SPON1Q9HCB6 807 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 KCND2Q9NZV8 630 aa2.45□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 USP22Q9UPT9 525 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 OSGIN2Q9Y236 505 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 PZPP20742 1482 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 GCC2Q8IWJ2 1684 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 C16orf96A6NNT2 1141 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 VILLO15195 856 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 KLK10O43240 276 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SBK3P0C264 359 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 JUPP14923 745 aa2.44□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 KCNA3P22001 575 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 ATP5DP30049 168 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 BPIFB4P59827 614 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 RPP30P78346 268 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 MC1RQ01726 317 aa2.44□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 TBR1Q16650 682 aa2.44□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.44□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa2.44□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 SYT8Q8NBV8 401 aa2.44□□□□□ -2.02
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PDE4D-218ENST00000509368 OR5M3Q8NGP4 307 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-218ENST00000509368 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.44□□□□□ -2.02
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