RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508523.5

GRAMD2B-208, Transcript of GRAM domain containing 2B, human

TSL 3

Gene GRAMD2B, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GRAMD2B-208	ENST00000508523	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GOLIM4	O00461	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	COG5	Q9UP83	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	EVPL	Q92817	2033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PEX2	P28328	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DUSP1	P28562	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	HOXD12	P35452	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF84	P51523	738 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MTA1	Q13330	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GJA10	Q969M2	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523		F8W810	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SLC28A2	O43868	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	IL18RAP	O95256	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	NDUFS1	P28331	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ARRB2	P32121	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DGKQ	P52824	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	FAM193A	P78312	1265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GRM3	Q14832	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	CNGA3	Q16281	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SPTLC2	O15270	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	TFEB	P19484	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	YY1	P25490	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZXDB	P98169	803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	GBX1	Q14549	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	MGEA5	O60502	916 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	USP12	O75317	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ATIC	P31939	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	POLD2	P49005	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	VPS41	P49754	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	RHD	Q02161	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	DMWD	Q09019	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PGM5	Q15124	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GRAMD2B-208	ENST00000508523	KCNQ3	O43525	872 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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