RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF425Q6IV72 752 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 P3H2Q8IVL5 708 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ERP27Q96DN0 273 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 COL15A1P39059 1388 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CLCA1A8K7I4 914 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 PRAMEF2O60811 474 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 RNF8O76064 485 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 WDR47O94967 919 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM225BP0DP42 221 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TM4SF4P48230 202 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 GPC5P78333 572 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CFHR3Q02985 330 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM14Q14142 442 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 TOMM20Q15388 145 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SEC23BQ15437 767 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC184Q52MB2 194 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 FNIP2Q9P278 1114 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-215ENST00000506510 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PPC4 97 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 H3BNC9 293 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 CLIC1O00299 241 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 APOL1O14791 398 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 DSCR3O14972 297 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 FYB1O15117 783 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 ARP10275 920 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 TNFAIP3P21580 790 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 GPS1Q13098 491 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 SLC14A1Q13336 389 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 Q4G0T1 1027 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 VSTM1Q6UX27 236 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 RANBP10Q6VN20 620 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA5Q8NB90 893 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 CCT6BQ92526 530 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 SGCZQ96LD1 299 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 TBATAQ96M53 351 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 CRB3Q9BUF7 120 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 E5RJQ4 531 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 AREL1O15033 823 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 MYL4P12829 197 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 RRM1P23921 792 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 PBX1P40424 430 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 MMP13P45452 471 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 MTAPQ13126 283 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 ACOX1Q15067 660 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 FAXCQ5TGI0 409 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 MAP4K1Q92918 833 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 KAZALD1Q96I82 304 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC138Q96M89 665 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 VPS45Q9NRW7 570 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 FZD4Q9ULV1 537 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 FCHO1O14526 889 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 ADAM10O14672 748 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 FIBPO43427 364 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 NCK2O43639 380 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-215ENST00000506510 COQ9O75208 318 aa5.44□□□□□ -1.54
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