RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNH6Q9H252 994 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HPS4Q9NQG7 708 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PARVAQ9NVD7 372 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 STOML2Q9UJZ1 356 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SCINQ9Y6U3 715 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MDM4O15151 490 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FYNP06241 537 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 AOC1P19801 751 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SDC4P31431 198 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP2R5DQ14738 602 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MPPE1Q53F39 396 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MPP7Q5T2T1 576 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRF1Q5T601 910 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TMC6Q7Z403 805 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DDIT4Q9NX09 232 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MARK1Q9P0L2 795 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 VCANP13611 3396 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM170BA6NMN3 283 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MFAP3LO75121 409 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV3-25P01717 112 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV3-27P01718 113 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ARSAP15289 507 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GJA4P35212 333 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF75DP51815 510 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TNK2Q07912 1038 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ANO4Q32M45 955 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MON1BQ7L1V2 547 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TAC4Q86UU9 113 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DENND1CQ8IV53 801 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM217AQ8IXS0 508 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PJA1Q8NG27 643 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CD101Q93033 1021 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC42Q96M95 316 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SYT11Q9BT88 431 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 WDCPQ9H6R7 721 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 M0QYT0 321 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ACSL4O60488 711 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GREM1O60565 184 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG13O75143 517 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 APODP05090 189 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP17A1P05093 508 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SKILP12757 684 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PDGFRAP16234 1089 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC25BP30305 580 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPN9P43378 593 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DEUP1Q05D60 604 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HGSNATQ68CP4 663 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 STRADAQ7RTN6 431 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RIN3Q8TB24 985 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NT5C3BQ969T7 300 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC39A13Q96H72 371 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NPY6RQ99463 290 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 BBS2Q9BXC9 721 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ISCUQ9H1K1 167 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD10Q9NUJ1 306 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DEC1Q9P2X7 70 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 31.8
SH3BP2-208ENST00000504294 AKR1B10O60218 316 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms