RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SH2D4AQ9H788 454 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 JMJD4Q9H9V9 463 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TDP1Q9NUW8 608 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf81C9J6K1 198 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CXCL11O14625 94 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS3O15072 1205 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 WDR46O15213 610 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 HAUS5O94927 633 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 IFNAR1P17181 557 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CTXN1P60606 82 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NOMO3P69849 1222 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SCAPQ12770 1279 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SNAPC2Q13487 334 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PKP1Q13835 747 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2A13Q16696 494 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 USH1GQ495M9 461 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CPXCR1Q8N123 301 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FAM184AQ8NB25 1140 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9A6Q92581 669 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 JADE3Q92613 823 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 HDAC10Q969S8 669 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 COA7Q96BR5 231 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MTMR8Q96EF0 704 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BOD1Q96IK1 185 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 INSL6Q9Y581 213 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRFP10586 1907 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MYH6P13533 1939 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BTBD19C9JJ37 291 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PDHXO00330 501 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SYT1P21579 422 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 C5AR1P21730 350 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GNAQP50148 359 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GUCY2FP51841 1108 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 STAT2P52630 851 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RCAN1P53805 252 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ITKQ08881 620 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PLS1Q14651 629 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 COG2Q14746 738 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB115Q30KQ5 88 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZNX1 250 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CHURC1Q8WUH1 139 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 LPAR1Q92633 364 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CAPNS2Q96L46 248 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf42Q96LP6 360 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K14Q99558 947 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 SLF1Q9BQI6 1058 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 RSAD1Q9HA92 442 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 VPS54Q9P1Q0 977 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 FEM1BQ9UK73 627 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 NID2Q14112 1375 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL33A6NCF5 533 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 H3BQV1 296 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 VWA5AO00534 786 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB5O15062 677 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ZBED4O75132 1171 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 DEXIO95424 95 aa5.34□□□□□ -1.55
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