RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PLXNA3	P51805	1871 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	TLDC2	A0PJX2	215 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CARNS1	A5YM72	827 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	C5orf60	A6NFR6	353 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101		M0QYT0	321 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	DNM1L	O00429	736 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM66	O15016	1216 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	OPHN1	O60890	802 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	GCAT	O75600	419 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	FAM107A	O95990	144 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	IL4R	P24394	825 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	SERPINB6	P35237	376 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ATP1A2	P50993	1020 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF33A	Q06730	810 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MMRN1	Q13201	1228 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MTA1	Q13330	715 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	KCNJ11	Q14654	390 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	KYNU	Q16719	465 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	LHX8	Q68G74	356 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	LRRC31	Q6UY01	552 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	VPS52	Q8N1B4	723 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	RNF169	Q8NCN4	708 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	RNF139	Q8WU17	664 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	DEFB118	Q96PH6	123 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PKMYT1	Q99640	499 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	EPAS1	Q99814	870 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	SMO	Q99835	787 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MIOS	Q9NXC5	875 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	USP3	Q9Y6I4	520 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PIEZO1	Q92508	2521 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CDH23	Q9H251	3354 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ERICH4	A6NGS2	130 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	OR6C75	A6NL08	312 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	HHLA1	C9JL84	531 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CLDN5	O00501	218 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	EBAG9	O00559	213 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	NDUFAB1	O14561	156 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	KCNN4	O15554	427 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	HCRT	O43612	131 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ATP2C2	O75185	946 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	OAZ2	O95190	189 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	POMC	P01189	267 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MLN	P12872	115 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MX2	P20592	715 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	STX2	P32856	288 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	MAGEA11	P43364	429 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	GLUD2	P49448	558 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	GDF10	P55107	478 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	VSTM1	Q6UX27	236 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CCNJL	Q8IV13	435 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	ABI1	Q8IZP0	508 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC185	Q8N715	623 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UFD1-208	ENST00000484101	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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