RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CBX4O00257 560 aa17.04■□□□□ 0.32
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPEF2Q9C093 1822 aa17.03■□□□□ 0.32
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARC1Q5VT66 337 aa17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EEF1DP3Q658K8 133 aa17.02■□□□□ 0.32
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APBA2Q99767 749 aa17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa17.02■□□□□ 0.32
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM16O95361 564 aa17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L7P0C7H9 530 aa17.02■□□□□ 0.32
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PACS2Q86VP3 889 aa17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COLEC11Q9BWP8 271 aa17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ULBP1Q9BZM6 244 aa17.02■□□□□ 0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR23AA6NEV1 266 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEI4A8MW99 385 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAEPP09466 180 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HLA-DPA1P20036 260 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHKAP35790 457 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SKOR1P84550 965 aa17.02■□□□□ 0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLK2Q86UE8 772 aa17.02■□□□□ 0.31
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