RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.52□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 H0Y3Z8 333 aa5.52□□□□□ -1.53
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PRPF40A-208ENST00000472760 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 FEM1BQ9UK73 627 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 BAG5Q9UL15 447 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 RAB21Q9UL25 225 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 FZD4Q9ULV1 537 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa5.49□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa5.49□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 TBC1D3EA0A087X179 549 aa5.49□□□□□ -1.53
PRPF40A-208ENST00000472760 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.49□□□□□ -1.53
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