RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DTLQ9NZJ0 730 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 GGA2Q9UJY4 613 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 AP4E1Q9UPM8 1137 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NUP205Q92621 2012 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQY0 241 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ERICH4A6NGS2 130 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 E7EVH7 732 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 F8W810 466 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 APOL1O14791 398 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 CDH16O75309 829 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DDHD2O94830 711 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 OAZ2O95190 189 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 COL6A1P12109 1028 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SKIP12755 728 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 LCP1P13796 627 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 VAV1P15498 845 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TPSB2P20231 275 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PCSK1P29120 753 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 HOXC13P31276 330 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ADRA1BP35368 520 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 HCAR3P49019 387 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 BCAR1P56945 870 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ROR1Q01973 937 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA5AQ13591 1074 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TPSAB1Q15661 275 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 HIF1AQ16665 826 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CDO1Q16878 200 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 LONRF1Q17RB8 773 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TCTN1Q2MV58 587 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 TRABD2AQ86V40 505 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PACS2Q86VP3 889 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PYROXD2Q8N2H3 581 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MCUQ8NE86 351 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 MYLPFQ96A32 169 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf72Q96LT7 481 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PPCSQ9HAB8 311 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 IL37Q9NZH6 218 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 BRCA2P51587 3418 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MYLKQ15746 1914 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FAM92AA1XBS5 289 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 GMNCA6NCL1 334 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CASTOR2A6NHX0 329 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.85□□□□□ -1.47
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