RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GAB3Q8WWW8 586 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 STAMQ92783 540 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HAPLN3Q96S86 360 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OCEL1Q9H607 264 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SOGA1O94964 1423 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS47A8MTI9 375 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 31.5
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PTPRC-209ENST00000442510 CDH16O75309 829 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ABL1P00519 1130 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 POLR2MP0CAP2 368 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 S100PP25815 95 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 CDK9P50750 372 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 UGT2B15P54855 530 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PICALMQ13492 652 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TC2NQ8N9U0 490 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RFFLQ8WZ73 363 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 BIRC8Q96P09 236 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CTRCQ99895 268 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf62Q9BQA9 187 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ACEP12821 1306 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TSTD3H0UI37 97 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D4O60343 1298 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PEX11AO75192 247 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GNAO1P09471 354 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 FNTBP49356 437 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RGS6P49758 472 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TUBP50607 506 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CEBPGP53567 150 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GPR162Q16538 588 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ULK3Q6PHR2 472 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RAD9BQ6WBX8 426 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SSH2Q76I76 1423 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf56Q8IXR9 622 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 AADATQ8N5Z0 425 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NR4A3Q92570 626 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 AK8Q96MA6 479 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 IFT46Q9NQC8 304 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NCOA2Q15596 1464 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF233A6NK53 670 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 H7C1D1 291 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 AQP9O43315 295 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CCNE2O96020 404 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 TPMTP51580 245 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 P2RX3P56373 397 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-209ENST00000442510 GNA12Q03113 381 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf89Q6UX73 402 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZNX1 250 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SSX6Q7RTT6 188 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MPP5Q8N3R9 675 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PYDC1Q8WXC3 89 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TESCQ96BS2 214 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.74□□□□□ -1.49
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