RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 FOPNLQ96NB1 174 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 PGDP52209 483 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 ACTR2P61160 394 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 KLK14Q9P0G3 267 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 MAGEB16A2A368 324 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 MAGEA13PA6NCF6 341 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 SHBGP04278 402 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 COG2Q14746 738 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 E2F7Q96AV8 911 aa11.9□□□□□ -0.5
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFB5O43674 189 aa11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PYGMP11217 842 aa11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SEZ6Q53EL9 994 aa11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PDP2Q9P2J9 529 aa11.9□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KRT36O76013 467 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ENDOD1O94919 500 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ARF5P84085 180 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 NCOA4Q13772 614 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF677Q86XU0 584 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 HES6Q96HZ4 224 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TBC1D4O60343 1298 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 DGAT1O75907 488 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 RIT2Q99578 217 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 LRFN1Q9P244 771 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 RAB19A4D1S5 217 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MYL2P10916 166 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KDELC1Q6UW63 502 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 OR8H2Q8N162 312 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 BBS1Q8NFJ9 593 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SPATA18Q8TC71 538 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 JADE3Q92613 823 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM237Q96Q45 408 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 EHD1Q9H4M9 534 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 LOC100653049A0A140TA62 436 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SPTLC1O15269 473 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KRT34O76011 436 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MAP3K6O95382 1288 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PDGFRAP16234 1089 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PTPN4P29074 926 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 NCALDP61601 193 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 INPP5AQ14642 412 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SSX2Q16385 188 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SLC9A6Q92581 669 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 KAT2BQ92831 832 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 PSTPIP1O43586 416 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 NPTXRO95502 500 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 RARAP10276 462 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CDC25CP30307 473 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 AGAP11Q8TF27 550 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 MIEF2Q96C03 454 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CDYLQ9Y232 598 aa11.89□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 AGPSO00116 658 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 SPAG6O75602 509 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 APOA1P02647 267 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 ARL3P36405 182 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 CHI3L2Q15782 390 aa11.88□□□□□ -0.51
CCBE1-202ENST00000439986 DCAF6Q58WW2 860 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms