RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438682.5

PPARG-211, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

TSL 3

Gene PPARG, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-211ENST00000438682 MYD88Q99836 296 aa6.69□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 GDF15Q99988 308 aa6.69□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.69□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.69□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.69□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 RRHO14718 337 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 BMP15O95972 392 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 FGBP02675 491 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 DUSP1P28562 367 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 STIM1Q13586 685 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 TTC30AQ86WT1 665 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.68□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 OR2W5A6NFC9 320 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 GAB1Q13480 694 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 SRLQ86TD4 932 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 PIGKQ92643 395 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 KIAA1191Q96A73 305 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 FCRL5Q96RD9 977 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 TM2D2Q9BX73 214 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 FNIP2Q9P278 1114 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.67□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 J3KTA2 159 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 PLAUP00749 431 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 IGKV2-30P06310 120 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 CD63P08962 238 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 MATN1P21941 496 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 CPA2P48052 419 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 HSPA7P48741 367 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 HSF1Q00613 529 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 CFHR1Q03591 330 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 MTA1Q13330 715 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 MPEG1Q2M385 716 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 C10orf25Q5T742 122 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 ACSM6Q6P461 480 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 COQ8BQ96D53 544 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.66□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 CTSAP10619 480 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 NR4A2P43354 598 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 PMM1Q92871 262 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 HMCESQ96FZ2 354 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PPARG-211ENST00000438682 SOCS2O14508 198 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 PRYO14603 147 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 ST6GAL1P15907 406 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 ABCB4P21439 1286 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 NDUFS1P28331 727 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 HOXD12P35452 270 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 CSHL1Q14406 222 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 RAB30Q15771 203 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 UEVLDQ8IX04 471 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 NRACQ8N912 160 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 ZBTB9Q96C00 473 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.64□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 NPC1O15118 1278 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 TLR2O60603 784 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 USP12O75317 370 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 PRF1P14222 555 aa6.63□□□□□ -1.35
PPARG-211ENST00000438682 SLC8A1P32418 973 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms