RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.15■■□□□ 1.78
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PLEKHF1-201ENST00000436066 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa26.15■■□□□ 1.78
PLEKHF1-201ENST00000436066 NRP1O14786 923 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 DGKIO75912 1065 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZWINTO95229 277 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 DEUP1Q05D60 604 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDK4Q16654 411 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 LVRNQ6Q4G3 990 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM35AQ86V20 835 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCUQ8NE86 351 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF139Q8WU17 664 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPOCK2Q92563 424 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 OLFM3Q96PB7 478 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.14■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPR182O15218 404 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 INHBAP08476 426 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 MGAT3Q09327 533 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 HTR3CQ8WXA8 447 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRAMD1AQ96CP6 724 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNK16Q96T55 309 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMOQ99835 787 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRKAG3Q9UGI9 489 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAPN9O14815 690 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 CREB3O43889 395 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 MFSD11O43934 449 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 VAV1P15498 845 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SREBF2Q12772 1141 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 LGMNQ99538 433 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIGVQ9NUD9 493 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTLL3Q9Y4R7 772 aa26.13■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 HACD1B0YJ81 288 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 H3BRJ5 948 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 MT-ND3P03897 115 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FCGRTP55899 365 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM32Q13049 653 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 NETO2Q8NC67 525 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF169Q8NCN4 708 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC7A14Q8TBB6 771 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC8CQ8TDW0 803 aa26.12■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 E7ENQ6 273 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FBXO21O94952 628 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FYNP06241 537 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 TPSB2P20231 275 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 THPOP40225 353 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 CACNA2D1P54289 1103 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAAP100Q0VG06 881 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 TPSAB1Q15661 275 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 RGS9BPQ6ZS82 235 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF534Q76KX8 674 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 BANPQ8N9N5 519 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZMIZ2Q8NF64 920 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 TCP10LQ8TDR4 215 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHTF1Q9UMS5 762 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC12A4Q9UP95 1085 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 CD52P31358 61 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 DAOAP59103 153 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 CTAGE3PQ8IX95 158 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADAM32Q8TC27 787 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC39Q96DD0 335 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLCD4Q9BRC7 762 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLAC1Q9HBJ0 212 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM30AQ9NV96 361 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDH9Q9ULB4 789 aa26.11■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEPT4O43236 478 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADRA1DP25100 572 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAGEA3P43357 314 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FLT3LGP49771 235 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEMA5AQ13591 1074 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 UPP1Q16831 310 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 TIGD5Q53EQ6 642 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPM1NQ8N819 430 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLHL14Q9P2G3 628 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 PADI3Q9ULW8 664 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 C1QAP02745 245 aa26.1■■□□□ 1.77
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASGR1P07306 291 aa26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms