RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 DENND1CQ8IV53 801 aa21.8■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 LMO3Q8TAP4 145 aa21.8■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.8■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.8■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 KCNA4P22459 653 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF132P52740 706 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 SHC2P98077 582 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 LMAN2Q12907 356 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 LRMPQ12912 555 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 GEN1Q17RS7 908 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 TFAP2BQ92481 460 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 NT5C1BQ96P26 610 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 RAD54BQ9Y620 910 aa21.79■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 E7ENQ6 273 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 CYBBP04839 570 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 ITPKAP23677 461 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 DAOAP59103 153 aa21.78■■□□□ 1.08
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UBXN4-204ENST00000426921 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 ISM2Q6H9L7 571 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM270Q6UE05 265 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 UBA3Q8TBC4 463 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 WASH3PC4AMC7 463 aa21.77■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 LATS1O95835 1130 aa21.77■■□□□ 1.08
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UBXN4-204ENST00000426921 ZNF445P59923 1031 aa21.77■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 MORC3Q14149 939 aa21.77■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 E2F5Q15329 346 aa21.77■■□□□ 1.08
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UBXN4-204ENST00000426921 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.77■■□□□ 1.08
UBXN4-204ENST00000426921 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.77■■□□□ 1.08
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UBXN4-204ENST00000426921 GABBR2O75899 941 aa21.76■■□□□ 1.07
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UBXN4-204ENST00000426921 IL12RB1P42701 662 aa21.76■■□□□ 1.07
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UBXN4-204ENST00000426921 CNGA2Q16280 664 aa21.76■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.76■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.76■■□□□ 1.07
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UBXN4-204ENST00000426921 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.76■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 CEP76Q8TAP6 659 aa21.76■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 RNF139Q8WU17 664 aa21.76■■□□□ 1.07
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UBXN4-204ENST00000426921 IRGQQ8WZA9 623 aa21.76■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 KAT5Q92993 513 aa21.76■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.76■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.76■■□□□ 1.07
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UBXN4-204ENST00000426921 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 ENGP17813 658 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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UBXN4-204ENST00000426921 FUT11Q495W5 492 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 PMF1Q6P1K2 205 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 DDI1Q8WTU0 396 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 EDEM1Q92611 657 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 CAPN10Q9HC96 672 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 CACNA1BQ00975 2339 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.75■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN4-204ENST00000426921 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.74■■□□□ 1.07
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