RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 SLC2A3P11169 496 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 PTPN9P43378 593 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SULT1E1P49888 294 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 RUNX3Q13761 415 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 EMC1Q8N766 993 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 EDAQ92838 391 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 DDIT4Q9NX09 232 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TNFRSF10AO00220 468 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 LCA5LO95447 670 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CYP1A2P05177 515 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 H2AFZP0C0S5 128 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ABCB4P21439 1286 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 GPD1P21695 349 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SDC4P31431 198 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 NR1H3Q13133 447 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CCDC14Q49A88 953 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 H2AFVQ71UI9 128 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 BNIPLQ7Z465 357 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 DENND1CQ8IV53 801 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TBCBQ99426 244 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 THAP2Q9H0W7 228 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 EBF3Q9H4W6 596 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 HPS4Q9NQG7 708 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 COL4A2P08572 1712 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 NFATC1O95644 943 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 GLULP15104 373 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ARSAP15289 507 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CCR1P32246 355 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CXCR3P49682 368 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 DEUP1Q05D60 604 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 NME3Q13232 169 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 MTA1Q13330 715 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 PPP2R5DQ14738 602 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 STRADAQ7RTN6 431 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CPA6Q8N4T0 437 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 MCEEQ96PE7 176 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 INTUQ9ULD6 942 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 APOEP02649 317 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CHKAP35790 457 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SLC11A2P49281 568 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TNK2Q07912 1038 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TMEM139Q8IV31 216 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CPXM2Q8N436 756 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 RNF34Q969K3 372 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 CNPY3Q9BT09 278 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ECT2Q9H8V3 914 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.42■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ACSL4O60488 711 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 TMEM253P0C7T8 217 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 DESP17661 470 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ATP11AP98196 1134 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 DHCR24Q15392 516 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 SPA17Q15506 151 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ADGRF1Q5T601 910 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.41■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.41■■□□□ 1.02
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