RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAYNQ6UX15 382 aa17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP49Q70CQ1 688 aa17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF248Q8NDW4 579 aa17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARID3AQ99856 593 aa17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK17AQ9UEE5 414 aa17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KNL1Q8NG31 2342 aa17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MGAQ8IWI9 3026 aa17.42■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATMQ13315 3056 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL6A6A6NMZ7 2263 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP1G2O75843 785 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FSBPO95073 299 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAU1O95793 577 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BMP15O95972 392 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CST3P01034 146 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C7P10643 843 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKCHP24723 683 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERICH1Q86X53 443 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FMNL3Q8IVF7 1028 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CIPCQ9C0C6 399 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBRSQ9HAH7 460 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGK2Q9HBY8 427 aa17.41■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM131Q92545 1883 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYBBP04839 570 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PGFP49763 221 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASP5P51878 434 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FYB2Q5VWT5 728 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAQR9Q6ZVX9 377 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TADA2BQ86TJ2 420 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBWD2Q8IUF1 395 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LURAP1LQ8IV03 231 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSC1Q92574 1164 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC2A11Q9BYW1 496 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT82Q9NSB4 513 aa17.4■□□□□ 0.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBX4O00257 560 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNTTP04053 509 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNNI1P19237 187 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLDCP23378 1020 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATICP31939 592 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPC3Q13507 836 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SV2BQ7L1I2 683 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAP25Q8TEE9 199 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC19Q96DA6 116 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCLK3Q9C098 648 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLCA2Q9UQC9 943 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCML2Q9UQR0 700 aa17.39■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STC2O76061 302 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLATP10515 647 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IDEP14735 1019 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C10orf120Q5SQS8 335 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FUKQ8N0W3 1084 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EID2Q8N6I1 236 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RFFLQ8WZ73 363 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMOQ99835 787 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLA2G4CQ9UP65 541 aa17.38■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CKAP5Q14008 2032 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC28A2O43868 658 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RARGP13631 454 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COG7P83436 770 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP40Q5TG30 622 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0895LQ68EN5 471 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZMIZ2Q8NF64 920 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SORCS1Q8WY21 1168 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLGA1Q92805 767 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 P2RY11Q96G91 374 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CGRRF1Q99675 332 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ORAI3Q9BRQ5 295 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEMA4CQ9C0C4 833 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OSER1Q9NX31 292 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPBP1Q9NZL4 362 aa17.37■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPC4 97 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BQV1 296 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CKMT2P17540 419 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSEN1P49768 467 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSRP3P50461 194 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K7CLP57077 242 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRIN1Q05586 938 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE4CQ08493 712 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LY6DQ14210 128 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa17.36■□□□□ 0.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LSMEM2Q8N112 164 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms