RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414154.6

SMIM19-201, Transcript of small integral membrane protein 19, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM19, Length 793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19-201ENST00000414154 PMS2CLQ68D20 193 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CPXM2Q8N436 756 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 MIS12Q9H081 205 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TSPAN3O60637 253 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 KRT5P13647 590 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 HOXB2P14652 356 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CHKAP35790 457 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SGSHP51688 502 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CREB5Q02930 508 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TMEM215Q68D42 235 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 MLKLQ8NB16 471 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PLD4Q96BZ4 506 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 HSFY1Q96LI6 401 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SIX2Q9NPC8 291 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.49■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SLC30A4O14863 429 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 ALDH1A2O94788 518 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 RHOBTB1O94844 696 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PON1P27169 355 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 FOXK2Q01167 660 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 ELF2Q15723 593 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 RNF139Q8WU17 664 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 GABRG3Q99928 467 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CD93Q9NPY3 652 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PATE3B3GLJ2 98 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 IGLV3-27P01718 113 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 LTFP02788 710 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 STILQ15468 1287 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CHPFQ8IZ52 775 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PGBD3Q8N328 593 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 NETO1Q8TDF5 533 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 IRGQQ8WZA9 623 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 RTKNQ9BST9 563 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TM4SF5O14894 197 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CAVIN2O95810 425 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 NDUFV2P19404 249 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 PTGER3P43115 390 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 DEFB119Q8N690 84 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 DDI1Q8WTU0 396 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 VPS45Q9NRW7 570 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM19-201ENST00000414154 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 SDHBP21912 280 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 SLC6A4P31645 630 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 IL12RB1P42701 662 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 MIIPQ5JXC2 388 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 GBP6Q6ZN66 633 aa20.45■□□□□ 0.86
SMIM19-201ENST00000414154 ST7Q9NRC1 585 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms