RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JAM2P57087 298 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAB4Q2WGN9 574 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FIGNQ5HY92 759 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPP7Q5T2T1 576 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRF1Q5T601 910 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYT13Q7L8C5 426 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARCQ7LC44 396 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TERB1Q8NA31 727 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHFRQ96EP1 664 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BBS2Q9BXC9 721 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.94□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1B0GTH6 734 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H0Y858 1186 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GFRA2O00451 464 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF40O75150 1001 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TULP3O75386 442 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DAB1O75553 588 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TDGF1P13385 188 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TYRP14679 529 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FERP16591 822 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBX4P57082 545 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK17Q00537 523 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDR2Q01850 454 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IQCB1Q15051 598 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANO4Q32M45 955 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPPE1Q53F39 396 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C11orf74Q86VG3 221 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC8Q8TAM2 541 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UCMAQ8WVF2 138 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C18orf8Q96DM3 657 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CPXM1Q96SM3 734 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXO10Q9UK96 956 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.93□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MDM4O15151 490 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIMM44O43615 452 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LILRB5O75023 590 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH1A2O94788 518 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 F9P00740 461 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINC1P01008 464 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EGFP01133 1207 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV3-25P01717 112 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP1A3P13637 1013 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOS2P35228 1153 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DGKGP49619 791 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DGKEP52429 567 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OXCT1P55809 520 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOMO3P69849 1222 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC6A3Q01959 620 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APBA1Q02410 837 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAS6Q14393 721 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EOGTQ5NDL2 527 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF43Q68DV7 783 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LONP2Q86WA8 852 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERICH1Q86X53 443 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM25Q86YD3 366 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND1CQ8IV53 801 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP33Q8TEY7 942 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EDEM1Q92611 657 aa8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC39A13Q96H72 371 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.9 ms