RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PIRO00625 290 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 COPEO14579 308 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 GPR32O75388 356 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PYGBP11216 843 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 SIGLEC10Q96LC7 697 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 ZNF560Q96MR9 790 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 HAO1Q9UJM8 370 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 NME7Q9Y5B8 376 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 FAM159BA6NKW6 160 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8RI6L899 631 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 APRTP07741 180 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 SERPINB4P48594 390 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PRMT2P55345 433 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF6Q15052 776 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 XKR4Q5GH76 650 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 TIFABQ6ZNK6 161 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PLLPQ9Y342 182 aa24.6■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 A8MXQ7 604 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 TRIM49D1C9J1S8 452 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 AVILO75366 819 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 ANP32DO95626 131 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 TARSP26639 723 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 FDFT1P37268 417 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 CCNJLQ8IV13 435 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PPM1NQ8N819 430 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 CFAP36Q96G28 342 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PLAC1Q9HBJ0 212 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 SCN1AP35498 2009 aa24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 NRCAMQ92823 1304 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 ARFIP2P53365 341 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 KRT72Q14CN4 511 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PTPRN2Q92932 1015 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 C7orf26Q96N11 449 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 FAM111AQ96PZ2 611 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.58■■□□□ 1.53
PMS1-205ENST00000409985 PPEF2O14830 753 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 DGKIO75912 1065 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 KCNE1P15382 129 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 GRK4P32298 578 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 ATG16L1Q676U5 607 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 OLFM3Q96PB7 478 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 KAT6AQ92794 2004 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 WDR91A4D1P6 747 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 INHAP05111 366 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 DLDP09622 509 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 NAB1Q13506 487 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 KIZQ2M2Z5 673 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 STEAP4Q687X5 459 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 ZNF534Q76KX8 674 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.57■■□□□ 1.52
PMS1-205ENST00000409985 SKA1Q96BD8 255 aa24.57■■□□□ 1.52
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