RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 BACE1P56817 501 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 RTP1P59025 263 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MED21Q13503 144 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PRPSAP1Q14558 356 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ZNF280DQ6N043 979 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PARP8Q8N3A8 854 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 AGAP2Q99490 1192 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SH3GL3Q99963 347 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 AURKCQ9UQB9 309 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TYROBPO43914 113 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ARIH2O95376 493 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PYGLP06737 847 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MCL1Q07820 350 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CNGA3Q16281 694 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PMF1Q6P1K2 205 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SNX32Q86XE0 403 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 BANPQ8N9N5 519 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 NAT14Q8WUY8 206 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 LRGUKQ96M69 825 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PAPPAQ13219 1627 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TMEM233B4DJY2 109 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CTSHP09668 335 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TFDP2Q14188 446 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 GK3PQ14409 553 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 POU6F1Q14863 301 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CDKL2Q92772 493 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 21.4
SNX13-201ENST00000409076 PHF21BQ96EK2 531 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MPP4Q96JB8 637 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PORCNQ9H237 461 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 VCX3BQ9H321 246 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.59□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 PMPCBO75439 489 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 CHRNGP07510 517 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 NT5C2P49902 561 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 COPAP53621 1224 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 IL1RL1Q01638 556 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 DLG1Q12959 904 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 RALGDSQ12967 914 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 RIPK1Q13546 671 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 TNFAIP1Q13829 316 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 XYLT1Q86Y38 959 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 NUP93Q8N1F7 819 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 CCDC185Q8N715 623 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 ZNF333Q96JL9 665 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 CDRT15Q96T59 188 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 OSMRQ99650 979 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 CHST12Q9NRB3 414 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 SENP1Q9P0U3 644 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 CSADQ9Y600 493 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 CNTNAP1P78357 1384 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SNX13-201ENST00000409076 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.042e-7■□□□□ 10
SNX13-201ENST00000409076 MPSTP25325 297 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms