RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC35C1Q96A29 364 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ELMO3Q96BJ8 720 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPM1 405 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 C2orf71A6NGG8 1288 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EXTL3O43909 919 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 LRPAP1P30533 357 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 STXBP2Q15833 593 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PRMT9Q6P2P2 845 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 BAP1Q92560 729 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SPOCK2Q92563 424 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 FAM136AQ96C01 138 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 OSBPL6Q9BZF3 934 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 FEM1BQ9UK73 627 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 COQ6Q9Y2Z9 468 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RWDD3Q9Y3V2 267 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MADDQ8WXG6 1647 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PMPCBO75439 489 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PIK3R1P27986 724 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ADSSP30520 456 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PSEN1P49768 467 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NCF4Q15080 339 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 LDLRAP1Q5SW96 308 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 LDHDQ86WU2 507 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EID3Q8N140 333 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ZNF570Q96NI8 536 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SLAIN2Q9P270 581 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CLTCL1P53675 1640 aa10.05□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 WDR27A2RRH5 827 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CCNA1P78396 465 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 FCHO2Q0JRZ9 810 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TRABD2AQ86V40 505 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TRPC4APQ8TEL6 797 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 S100ZQ8WXG8 99 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PHF21BQ96EK2 531 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NMUR2Q9GZQ4 415 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 RNF146Q9NTX7 359 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 A0A096LPK6 155 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ZNF197O14709 1029 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EFCAB14O75071 495 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 ASMTLO95671 621 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SERPINA6P08185 405 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PDGFRBP09619 1106 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CRKP46108 304 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 DCAF6Q58WW2 860 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 C6orf52Q5T4I8 152 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SETD9Q8NE22 299 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MBOAT7Q96N66 472 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 APOL5Q9BWW9 433 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 KLHL31Q9H511 634 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MAN1C1Q9NR34 630 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 DSEQ9UL01 958 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 TBX20Q9UMR3 447 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SHROOM2Q13796 1616 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 KLHL33A6NCF5 533 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MSH4O15457 936 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SOAT2O75908 522 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 PIGNO95427 931 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 EFNA5P52803 228 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 COX10Q12887 443 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 MYBPC2Q14324 1141 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SNX17Q15036 470 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 SEC23AQ15436 765 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 STILQ15468 1287 aa10.04□□□□□ -0.8
HERC3-202ENST00000402738 NFIL3Q16649 462 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms