RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381551.8

PDGFB-202, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDGFB, Length 1,125 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-202ENST00000381551 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.11■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 DDIT4Q9NX09 232 aa16.11■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.11■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 IRF1P10914 325 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 CXCR3P49682 368 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 ATP11AP98196 1134 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 USP4Q13107 963 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 NME3Q13232 169 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 GJD3Q8N144 294 aa16.1■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 PIGVQ9NUD9 493 aa16.1■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 TFR2Q9UP52 801 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.1■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.09■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 NRDCO43847 1150 aa16.09■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 TDGQ13569 410 aa16.09■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 PPP2R5DQ14738 602 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 RAB6CQ53S08 254 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 Q6ZNB5 142 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 STRADAQ7RTN6 431 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 RNF135Q8IUD6 432 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 AZIN2Q96A70 460 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 DESI2Q9BSY9 194 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 DCLK3Q9C098 648 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 RAB6CQ9H0N0 254 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 COX16Q9P0S2 106 aa16.09■□□□□ 0.17
PDGFB-202ENST00000381551 ADGRG1Q9Y653 693 aa16.09■□□□□ 0.17
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PDGFB-202ENST00000381551 HDAC4P56524 1084 aa16.08■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 CDO1Q16878 200 aa16.08■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.08■□□□□ 0.16
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PDGFB-202ENST00000381551 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.08■□□□□ 0.16
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PDGFB-202ENST00000381551 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
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PDGFB-202ENST00000381551 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.08■□□□□ 0.16
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PDGFB-202ENST00000381551 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.08■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.08■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 MYO1FO00160 1098 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 ACAP1Q15027 740 aa16.07■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
PDGFB-202ENST00000381551 RFFLQ8WZ73 363 aa16.07■□□□□ 0.16
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PDGFB-202ENST00000381551 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.07■□□□□ 0.16
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