RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369875.3

CNNM2-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM2, Length 2,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2-201ENST00000369875 TTPALQ9BTX7 342 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 WDCPQ9H6R7 721 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 TRIM66O15016 1216 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 CSF2RAP15509 400 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 LMAN1P49257 510 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SLC29A2Q14542 456 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 KCTD16Q68DU8 428 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SLC9A7Q96T83 725 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.54■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 H3BRJ5 948 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 I6L893 689 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 KCNN4O15554 427 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 F9P00740 461 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SHBGP04278 402 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 NUP93Q8N1F7 819 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 TRIM62Q9BVG3 475 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.53■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 GOLGA6CA6NDK9 693 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 GOLGA6DP0CG33 693 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 RBL1P28749 1068 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 STIP1P31948 543 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 NETO2Q8NC67 525 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 FAM72CH0Y354 149 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 RIPK2O43353 540 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 FAM72AQ5TYM5 149 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 FAM72DQ6L9T8 149 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 ANKS3Q6ZW76 656 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SCD5Q86SK9 330 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 FAM72BQ86X60 149 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 NTAN1Q96AB6 310 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 C8orf48Q96LL4 319 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 CWH43Q9H720 699 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 NMUR1Q9HB89 426 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CNNM2-201ENST00000369875 A0A1W2PQH9 124 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 MTMR11A4FU01 709 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 GOLGA8MH3BSY2 632 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 H7C4K7 107 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 ACSL3O95573 720 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 RFC2P35250 354 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 AIF1P55008 147 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 BASP1P80723 227 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 DEFB103AP81534 67 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 SNX10Q9Y5X0 201 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 CDY1Q9Y6F8 540 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 MYZAPP0CAP1 466 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 CXCR3P49682 368 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 C1QTNF8P60827 252 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 USP46P62068 366 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 MORF4L2Q15014 288 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 CRISPLD1Q9H336 500 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 USP29Q9HBJ7 922 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 DTLQ9NZJ0 730 aa25.51■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 C2CD2LO14523 706 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 TIMP1P01033 207 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 ACRP10323 421 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 RAG1P15918 1043 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 ACTN2P35609 894 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 MAGEA11P43364 429 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 SCAPQ12770 1279 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 GPR17Q13304 367 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 RFX8Q6ZV50 586 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 TOP1MTQ969P6 601 aa25.5■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.678e-7■■■■■ 30
CNNM2-201ENST00000369875 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 MFSD11O43934 449 aa25.49■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 ZSCAN26Q16670 478 aa25.49■■□□□ 1.67
CNNM2-201ENST00000369875 KRT71Q3SY84 523 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms