RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D4O60343 1298 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 AKAP5P24588 427 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 NTSR1P30989 418 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 DNASE1L3Q13609 305 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PGM5Q15124 567 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 WDR81Q562E7 1941 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 BTBD18B2RXH4 712 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PIAS2O75928 621 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 KITP10721 976 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ4P48050 445 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MAP3K14Q99558 947 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GVY2 172 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 FAM227AF5H4B4 570 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PRYO14603 147 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 IFNA2P01563 188 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 VPS41P49754 854 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MICU3Q86XE3 530 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 UEVLDQ8IX04 471 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 WBP2Q969T9 261 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SPRY4Q9C004 299 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 TMX1Q9H3N1 280 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 VPS51Q9UID3 782 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ABCC9O60706 1549 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PCYT1AP49585 367 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 COPAP53621 1224 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 POU5F1BQ06416 359 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 Q0VFX4 171 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 COASYQ13057 564 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 STK3Q13188 491 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 GAB1Q13480 694 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CNGA3Q16281 694 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PPL8 197 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 INAFM1C9JVW0 142 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 AP1G1O43747 822 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CLSTN1O94985 981 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 WNT1P04628 370 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 HTR7P34969 479 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CLCA4Q14CN2 919 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 DCLK3Q9C098 648 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CDT1Q9H211 546 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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