RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 APOL5Q9BWW9 433 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF700Q9H0M5 742 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCNK9Q9NPC2 374 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDGFCQ9NRA1 345 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 VPS45Q9NRW7 570 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 HELLSQ9NRZ9 838 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 TBC1D23Q9NUY8 699 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 MTMR4Q9NYA4 1195 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 ELOVL5Q9NYP7 299 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 RGL1Q9NZL6 768 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 NFU1Q9UMS0 254 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-407P-201ENST00000365280 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC187A0A096LP49 1063 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYMKA6NI61 221 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTC34A8MYJ7 566 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLIC1O00299 241 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 SOCS2O14508 198 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 FCHO1O14526 889 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 FYB1O15117 783 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 DHHO43323 396 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TLR2O60603 784 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNFSF4P23510 183 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 NTSR1P30989 418 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 NR4A2P43354 598 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC12A2P55011 1212 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TBX4P57082 545 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 WDR5P61964 334 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ID2Q02363 134 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 PICALMQ13492 652 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 PMS2P11Q13670 270 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM110CQ1W6H9 321 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARL13BQ3SXY8 428 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF260Q3ZCT1 412 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 GRHL2Q6ISB3 625 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 DLK2Q6UY11 383 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 C11orf44Q8N8P7 122 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 DEPTORQ8TB45 409 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 RSC1A1Q92681 617 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC46Q96FV0 321 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 SIGLEC11Q96RL6 698 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 SENP7Q9BQF6 1050 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUAK2Q9H093 628 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 VPS16Q9H269 839 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 EBF3Q9H4W6 596 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARNT2Q9HBZ2 717 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASAP1Q9ULH1 1129 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 DTNAQ9Y4J8 743 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCNU1A8MYU2 1149 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 APAF1O14727 1248 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 INPPL1O15357 1258 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTIFO43310 598 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRAMEF2O60811 474 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 OAZ2O95190 189 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 NTSR2O95665 410 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD63P08962 238 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CTSAP10619 480 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TFEBP19484 476 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPS6KB1P23443 525 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 GALNSP34059 522 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 HOXD12P35452 270 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 PBX1P40424 430 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARHGAP25P42331 645 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAE1P78406 368 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC14A1Q13336 389 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CSHL1Q14406 222 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CNGA3Q16281 694 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM196Q5HYL7 178 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACSM6Q6P461 480 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 RINLQ6ZS11 566 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 PIP4P1Q86T03 277 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTC30AQ86WT1 665 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 P3H2Q8IVL5 708 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 UEVLDQ8IX04 471 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 LAS2Q8IYD9 372 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 GLIS1Q8NBF1 620 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASB12Q8WXK4 309 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIPOR3Q96MK2 946 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-407P-201ENST00000365280 TBCBQ99426 244 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms