RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.48■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 NAT9Q9BTE0 207 aa16.48■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CIPCQ9C0C6 399 aa16.48■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 O00370 1275 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 FGFR2P21802 821 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 GRIK3Q13003 919 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ZSWIM7Q19AV6 140 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 FKBP6O75344 327 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 PTPN4P29074 926 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ITGA9Q13797 1035 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 RNF180Q86T96 592 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 EXD1Q8NHP7 514 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 LRRC39Q96DD0 335 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ADGRE3Q9BY15 652 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 SCNN1BP51168 640 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CLCN3P51790 818 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CPB2Q96IY4 423 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 UBOX5O94941 541 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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RXRA-201ENST00000356384 SLC22A9Q8IVM8 553 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 KYQ8NBH2 561 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CYLDQ9NQC7 956 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 GPR182O15218 404 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 BCAT1P54687 386 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 EMC1Q8N766 993 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.47■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 TMEM114B3SHH9 223 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CETPP11597 493 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 DDI2Q5TDH0 399 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ADI1Q9BV57 179 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CEP44Q9C0F1 390 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 CHKBQ9Y259 395 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.46■□□□□ 0.23
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RXRA-201ENST00000356384 MEI4A8MW99 385 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
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RXRA-201ENST00000356384 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 GATAD2AQ86YP4 633 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 ASNA1O43681 348 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 GRK4P32298 578 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 INPP4BO15327 924 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 POU6F1Q14863 301 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 PKN1Q16512 942 aa16.46■□□□□ 0.23
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RXRA-201ENST00000356384 TCF7L2Q9NQB0 619 aa16.46■□□□□ 0.23
RXRA-201ENST00000356384 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.46■□□□□ 0.23
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RXRA-201ENST00000356384 TM9SF1O15321 606 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 GRB10Q13322 594 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 SEMA4DQ92854 862 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 HS6ST1O60243 411 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 KRT6AP02538 564 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 VTNP04004 478 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 KRT6BP04259 564 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 KRT6CP48668 564 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 FGD3Q5JSP0 725 aa16.45■□□□□ 0.22
RXRA-201ENST00000356384 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.45■□□□□ 0.22
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