RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DLC1Q96QB1 1528 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PGK2P07205 417 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ASNSP08243 561 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PCNAP12004 261 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNJ1P48048 391 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMD3Q8N6K7 520 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC39A8Q9C0K1 460 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LACRTQ9GZZ8 138 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MKLN1Q9UL63 735 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EYA4O95677 639 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 COBLL1Q53SF7 1204 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AAGABQ6PD74 315 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO25Q8TCJ0 367 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PYDC1Q8WXC3 89 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TGM2P21980 687 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 YWHABP31946 246 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MTMR1Q13613 665 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 C11orf74Q86VG3 221 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK20Q8IZL9 346 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TCF7L2Q9NQB0 619 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf18Q9UK00 162 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L3A6NCW0 530 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L4A6NCW7 530 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RARBP10826 455 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PARP6Q2NL67 630 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC26A11Q86WA9 606 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FAR1Q8WVX9 515 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PP2D1A8MPX8 630 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MDM4O15151 490 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DRD4P21917 467 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 INSCQ1MX18 579 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BNIPLQ7Z465 357 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BTG4Q9NY30 223 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MGRN1O60291 552 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HAUS6Q7Z4H7 955 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSWIM1Q9BR11 485 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP9BO43861 1147 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 REM1O75628 298 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HSMCR30P0CW71 290 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PROSER3Q2NL68 480 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 C2orf81A6NN90 581 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ENTPD5O75356 428 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PAICSP22234 425 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HPCAL1P37235 193 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPK9P45984 424 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 VBP1P61758 197 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 OSBPL6Q9BZF3 934 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NAGPAQ9UK23 515 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF609O15014 1411 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINE1P05121 402 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2D6P10635 497 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ERCC2P18074 760 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKAL1Q5VV42 579 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DHDDSQ86SQ9 333 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DHFR2Q86XF0 187 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TRPV1Q8NER1 839 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 BAIAP2Q9UQB8 552 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PKP3Q9Y446 797 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SNAP23O00161 211 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MSL3P1P0C860 447 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SMCO1Q147U7 214 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 KDELC2Q7Z4H8 507 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HAT1O14929 419 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS26AO75436 327 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 VCLP18206 1134 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms