RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335760.9

APOBEC3B-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOBEC3B, Length 1,359 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-202ENST00000335760 NNTQ13423 1086 aa14.66□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.66□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 RNF34Q969K3 372 aa14.66□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 BTBD6Q96KE9 485 aa14.66□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 PIGVQ9NUD9 493 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.66□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 HTR3DQ70Z44 454 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 SLC39A13Q96H72 371 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3B-202ENST00000335760 DCLK3Q9C098 648 aa14.65□□□□□ -0.06
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APOBEC3B-202ENST00000335760 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.64□□□□□ -0.07
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APOBEC3B-202ENST00000335760 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.63□□□□□ -0.07
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APOBEC3B-202ENST00000335760 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 CHADO15335 359 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 PJA2O43164 708 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 RNF8O76064 485 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3B-202ENST00000335760 MTA2O94776 668 aa14.62□□□□□ -0.07
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