RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314675.11

UBXN11-201, Transcript of UBX domain protein 11, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene UBXN11, Length 2,254 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11-201ENST00000314675 FAAP100Q0VG06 881 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 NTAN1Q96AB6 310 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 B3GALT6Q96L58 329 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.63■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CFAP69A5D8W1 941 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FAM72CH0Y354 149 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TMEM63AO94886 807 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 F9P00740 461 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 AIF1P55008 147 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 XRCC4Q13426 336 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 HIF1AQ16665 826 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CENPUQ71F23 418 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CROCCP2Q86T23 111 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FAM72BQ86X60 149 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 ALOX15BO15296 676 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PPARDQ03181 441 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SCAPQ12770 1279 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 H3BRJ5 948 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 BANF1O75531 89 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CYP2C18P33260 490 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PBX3P40426 434 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SLC11A1P49279 550 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 WDCPQ9H6R7 721 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 MARCH5Q9NX47 278 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PAK5Q9P286 719 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CXCL10P02778 98 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CXCR3P49682 368 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PGFP49763 221 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 IRAK1P51617 712 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 GUCY1A3Q02108 690 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TLE2Q04725 743 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 MTM1Q13496 603 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 MSS51Q4VC12 460 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 RFX8Q6ZV50 586 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TAC4Q86UU9 113 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 VWA8A3KMH1 1905 aa20.61■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 NETO2Q8NC67 525 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 OLFM3Q96PB7 478 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SMAPO00193 183 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 ARL4CP56559 192 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 PPP2R2AP63151 447 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 GNGT1P63211 74 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SEMA3BQ13214 749 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 DPYSQ14117 519 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 DDR2Q16832 855 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TRIM60Q495X7 471 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 MFSD5Q6N075 450 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 STKLD1Q8NE28 680 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 LGMNQ99538 433 aa20.6■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 ERICH4A6NGS2 130 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 HOXA2O43364 376 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 MFSD11O43934 449 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 DGKIO75912 1065 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 KCNJ11Q14654 390 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 TTC25Q96NG3 672 aa20.59■□□□□ 0.89
UBXN11-201ENST00000314675 SERPINB12Q96P63 405 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms