RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 AKR1B10O60218 316 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 FECHP22830 423 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 SULT1E1P49888 294 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 TBX4P57082 545 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 CDK17Q00537 523 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.46□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 SERPINB11Q96P15 392 aa9.46□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 ECT2Q9H8V3 914 aa9.46□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN3O60637 253 aa9.45□□□□□ -0.9
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PDE4D-201ENST00000309641 DHCR24Q15392 516 aa9.45□□□□□ -0.9
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PDE4D-201ENST00000309641 PARVAQ9NVD7 372 aa9.45□□□□□ -0.9
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PDE4D-201ENST00000309641 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0U1RQJ8 604 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD62A6NC57 917 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-201ENST00000309641 RCCD1A6NED2 376 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-201ENST00000309641 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-201ENST00000309641 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-201ENST00000309641 CYP1A2P05177 515 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-201ENST00000309641 GPD1P21695 349 aa9.44□□□□□ -0.9
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