RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ABI1Q8IZP0 508 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 RRN3Q9NYV6 651 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 PAK5Q9P286 719 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 HCSTQ9UBK5 93 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 H3BRJ5 948 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 TNFRSF10BO14763 440 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ALOX15BO15296 676 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 MFSD11O43934 449 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SLC5A3P53794 718 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SEMA3BQ13214 749 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 DPYSQ14117 519 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 TTC25Q96NG3 672 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SERPINB12Q96P63 405 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FAM72CH0Y354 149 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SMAPO00193 183 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CCL5P13501 91 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 TAC4Q86UU9 113 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FAM72BQ86X60 149 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 APBB2Q92870 758 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SCLYQ96I15 445 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 RNF208Q9H0X6 261 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.74■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.918e-7■■■■■ 107
UBXN6-201ENST00000301281 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 E7ESA3 106 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SYN3O14994 580 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 TRAPPC3O43617 180 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CREB3O43889 395 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 TADA2AO75478 443 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ARL4CP56559 192 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 PPARDQ03181 441 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 LRRC31Q6UY01 552 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 RFX8Q6ZV50 586 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 MARCH5Q9NX47 278 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.73■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 GRIK1P39086 918 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.918e-8■■■■■ 27.6
UBXN6-201ENST00000301281 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CLUHO75153 1309 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 A6NNZ2 444 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CHADO15335 359 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 DGKIO75912 1065 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 VAV1P15498 845 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 CXCR3P49682 368 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 PLXNA3P51805 1871 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 MTM1Q13496 603 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 STAT4Q14765 748 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 BEND5Q7L4P6 421 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 EURLQ9NYK6 297 aa20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 DCLK1O15075 740 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 F9P00740 461 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 IGLV3-25P01717 112 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 IVLP07476 585 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 LSP1P33241 339 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 MMP13P45452 471 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SLC11A1P49279 550 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 PGFP49763 221 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 FAXCQ5TGI0 409 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 NETO2Q8NC67 525 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 B3GALT6Q96L58 329 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 HIPK3Q9H422 1215 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.71■□□□□ 0.91
UBXN6-201ENST00000301281 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms