RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 FAM72DQ6L9T8 149 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CROCCP2Q86T23 111 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 FAM72BQ86X60 149 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 NETO2Q8NC67 525 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 B3GALT6Q96L58 329 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 HIPK3Q9H422 1215 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP69A5D8W1 941 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 H3BRJ5 948 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF10BO14763 440 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ALOX15BO15296 676 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R2AP63151 447 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MSS51Q4VC12 460 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SCML4Q8N228 414 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 APBB2Q92870 758 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 NTAN1Q96AB6 310 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 RRN3Q9NYV6 651 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ACTN2P35609 894 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 XRCC4Q13426 336 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TAC4Q86UU9 113 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 STKLD1Q8NE28 680 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 RAB6BQ9NRW1 208 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PAK5Q9P286 719 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.57■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRDP23468 1912 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SYN3O14994 580 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD11O43934 449 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH2P05091 517 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SLC11A1P49279 550 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PGFP49763 221 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 RFX8Q6ZV50 586 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MARCH5Q9NX47 278 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.56■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 PBX3P40426 434 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ARL4CP56559 192 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 FAAP100Q0VG06 881 aa23.55■■□□□ 1.36
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VSTM4-201ENST00000298454 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.55■■□□□ 1.36
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VSTM4-201ENST00000298454 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD5Q6N075 450 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 OLFM3Q96PB7 478 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 WDCPQ9H6R7 721 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SCN5AQ14524 2016 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 F9P00740 461 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 AGTP01019 485 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MDH1P40925 334 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 GPR15P49685 360 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 AIF1P55008 147 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 DPYSQ14117 519 aa23.55■■□□□ 1.36
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VSTM4-201ENST00000298454 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB12Q96P63 405 aa23.55■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 DGKIO75912 1065 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD2P08910 425 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2C18P33260 490 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CXCR3P49682 368 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC31Q6UY01 552 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 LGMNQ99538 433 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TKTL2Q9H0I9 626 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA3BQ13214 749 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 DDR2Q16832 855 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM60Q495X7 471 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC38Q502W7 563 aa23.54■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.53■■□□□ 1.36
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