RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 FAF2Q96CS3 445 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 TRAPPC3O43617 180 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ITGB8P26012 769 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 GPR15P49685 360 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 GALTP07902 379 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 DPYSL2Q16555 572 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 MFSD5Q6N075 450 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ZNF670Q9BS34 389 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 FZD10Q9ULW2 581 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX17-201ENST00000297316 APOL1O14791 398 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CAPN15O75808 1086 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TMEM63AO94886 807 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SEC24CP53992 1094 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ARPP19P56211 112 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 DEUP1Q05D60 604 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 USP29Q9HBJ7 922 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.14■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 H7C0C1 242 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 I6L893 689 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 AGTP01019 485 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ATP5OP48047 213 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 MTM1Q13496 603 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 MSS51Q4VC12 460 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FUT10Q6P4F1 479 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 GOT1P17174 413 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SLC5A3P53794 718 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SLC20A2Q08357 652 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 DDR2Q16832 855 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 RTP2Q5QGT7 225 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 USP3Q9Y6I4 520 aa22.13■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SYN3O14994 580 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 GBE1Q04446 702 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CYP4X1Q8N118 509 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 NETO2Q8NC67 525 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TNFRSF10BO14763 440 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SOAT2O75908 522 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TGM2P21980 687 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 MMP13P45452 471 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 GJA8P48165 433 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 GPR152Q8TDT2 470 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.12■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 A6NNZ2 444 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CLTBP09497 229 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CREB1P16220 341 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FGFR3P22607 806 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 AMPD1P23109 780 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 RBL1P28749 1068 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CROCCP2Q86T23 111 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 VSIG1Q86XK7 387 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SERPINB12Q96P63 405 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms