RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRELID2Q8N945 189 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa24.81■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BEND5Q7L4P6 421 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EXD1Q8NHP7 514 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF139Q8WU17 664 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGLV3-25P01717 112 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHRNA3P32297 505 aa24.79■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLE6Q9H808 572 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL21Q9HBE4 155 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OBSL1O75147 1896 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.79■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFEMP1Q12805 493 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.79■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMC8Q8IU68 726 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.79■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C2orf78A6NCI8 922 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLR5O60602 858 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.78■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRD1A4D1F6 860 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM187AA6NFU0 413 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTI1O43156 1089 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRAK2O43187 625 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT7P08729 469 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GJA1P17302 382 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DESP17661 470 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CETN2P41208 172 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP6Q16828 381 aa24.77■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RUNDC3BQ96NL0 473 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CORO1BQ9BR76 489 aa24.77■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.77■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ESYT3A0FGR9 886 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 F11P03951 625 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT10P13645 584 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DR1Q01658 176 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADCY2Q08462 1091 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMRN1Q13201 1228 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CUL1Q13616 776 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.77■■□□□ 1.56
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GAREM2Q75VX8 874 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITIH5Q86UX2 942 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGFLR1Q9H665 355 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRN3Q9NYV6 651 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FZD10Q9ULW2 581 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RALAP11233 206 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSEN1P49768 467 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP4F8P98187 520 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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