RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SCINQ9Y6U3 715 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO1FO00160 1098 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF4O00268 1085 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP26A1O43174 497 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF862O60290 1169 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ECEL1O95672 775 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 EFEMP2O95967 443 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 AGTP01019 485 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 C8AP07357 584 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADRB2P07550 413 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT17P0C025 328 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SKIP12755 728 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGA4P13612 1032 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL12P48061 93 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP1A2P50993 1020 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB27AP51159 221 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PLTPP55058 493 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DLG4P78352 724 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FMO1Q01740 532 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCEQ02156 737 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPCQ03188 943 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GAS6Q14393 721 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD6Q15008 389 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R7Q15435 360 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP1B1Q16678 543 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LILRA6Q6PI73 481 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DEPTORQ8TB45 409 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GATA6Q92908 595 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PGBD4Q96DM1 585 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM167AQ96KS9 214 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP4Q96MN2 994 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK15Q96Q40 435 aa7.37□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC77Q9BR77 488 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLPH3Q9H4A6 298 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 WHRNQ9P202 907 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 WASF3Q9UPY6 502 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GMNCA6NCL1 334 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 E7EVH7 732 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PSTPIP1O43586 416 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF623O75123 536 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM107AO95990 144 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CPP00450 1065 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGRP01833 764 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CALB1P05937 261 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MMEP08473 750 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PAEPP09466 180 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RARGP13631 454 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNB2P17787 502 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TNNI1P19237 187 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ITIH2P19823 946 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ECHS1P30084 290 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MLH1P40692 756 aa7.36□□□□□ -1.23
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