RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM15Q13444 863 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 ZACNQ401N2 412 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM237Q96Q45 408 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 XYLT2Q9H1B5 865 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 STK39Q9UEW8 545 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 CDY1Q9Y6F8 540 aa27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 SYN3O14994 580 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.975e-9■□□□□ 8.4
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CAPNS1-201ENST00000246533 WSCD1Q658N2 575 aa27.34■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH3A1P30838 453 aa27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 COL19A1Q14993 1142 aa27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP61Q8NHU2 1237 aa27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D4O60343 1298 aa27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 PSEN1P49768 467 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 SV2CQ496J9 727 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM72Q6ZMU5 477 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE8Q86YQ8 564 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS1R2Q8TE23 839 aa27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF2P50749 326 aa27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF560Q96MR9 790 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 RTP3Q9BQQ7 232 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH22Q9UJ99 828 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 RASA4O43374 803 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 TGM5O43548 720 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 ANKS3Q6ZW76 656 aa27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 SOWAHAQ2M3V2 549 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR72Q3MJ13 1102 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CTXN3Q4LDR2 81 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM22Q9P0K1 906 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DRAP01903 254 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ODC1P11926 461 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA4P43358 317 aa27.3■■□□□ 1.96
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