RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217971.7

PGRMC1-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC1, Length 1,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1-201ENST00000217971 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.73□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 MDM4O15151 490 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CCL16O15467 120 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 IRAK2O43187 625 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 TLR5O60602 858 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 RFPL2O75678 378 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 ZMYND10O75800 440 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 TBX18O95935 607 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 KRT1P04264 644 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 GBP1P32455 592 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 PPP3CCP48454 512 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 ODF2Q5BJF6 829 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 ZNF276Q8N554 614 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 IL21Q9HBE4 155 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 LRRD1A4D1F6 860 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 F11P03951 625 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 BMP1P13497 986 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 KCNA5P22460 613 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 HOXA9P31269 272 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 PAFAH1B1P43034 410 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CXCR3P49682 368 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 DUSP6Q16828 381 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.055e-9■■■■■ 31.1
PGRMC1-201ENST00000217971 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 SERPINB11Q96P15 392 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CARD6Q9BX69 1037 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 LRRC3Q9BY71 257 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 WDCPQ9H6R7 721 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 DPP7Q9UHL4 492 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 FZD10Q9ULW2 581 aa14.72□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 FGGP02679 453 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 KDELR1P24390 212 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 NRIP1P48552 1158 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 EFEMP1Q12805 493 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 LLGL1Q15334 1064 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 TMC8Q8IU68 726 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 KRT222Q8N1A0 295 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 KCTD6Q8NC69 237 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 NTAN1Q96AB6 310 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CLDND1Q9NY35 253 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.71□□□□□ -0.05
PGRMC1-201ENST00000217971 CD48P09326 243 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 TUBP50607 506 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 ARSEP51690 589 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 AIF1P55008 147 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 CDH6P55285 790 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 COPS2P61201 443 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 CA9Q16790 459 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 HECTD3Q5T447 861 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 GAREM2Q75VX8 874 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 CEP112Q8N8E3 955 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 RNF34Q969K3 372 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 NOTCH4Q99466 2003 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 TTC28Q96AY4 2481 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 I6L893 689 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 GABRR2P28476 465 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 CCR1P32246 355 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 ADRA1BP35368 520 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 CETN2P41208 172 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 CDKN2BP42772 138 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 SCAPQ12770 1279 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 NNTQ13423 1086 aa14.7□□□□□ -0.06
PGRMC1-201ENST00000217971 KCNC3Q14003 757 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms