RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Xpo7Q9EPK7 1087 aa7.25□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Atp11cQ9QZW0 1129 aa7.25□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 PolP11369 1281 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 CremP27699 357 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 SykP48025 629 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppp1r7Q3UM45 361 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem102Q3UPR7 509 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 CttnQ60598 546 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Papd7Q6PB75 542 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gja6Q6S5G4 283 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lacc1Q8BZT9 430 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pex5lQ8C437 567 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cwf19l1Q8CI33 537 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mill1Q8HWE7 395 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 HyiQ8R1F5 277 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 NelfcdQ922L6 591 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 MutyhQ99P21 515 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 CoprsQ9CQ13 173 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slxl1Q9D515 155 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Adam23Q9R1V7 829 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Btbd18A0A0A6YY25 723 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm4302E9PX25 294 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cer1O55233 272 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 PigrO70570 771 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 UgcgO88693 394 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il2rbP16297 539 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cdc25bP30306 576 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Polr2cP97760 275 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mcm9Q2KHI9 1134 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ugt1a1Q63886 535 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ripor1Q68FE6 1223 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mvb12bQ6KAU4 317 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 RubcnQ80U62 956 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc9b1Q8C0X2 565 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 P3h2Q8CG71 703 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smtnl2Q8CI12 456 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tldc1Q8K0P3 455 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc35f6Q8VE96 372 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itm2cQ91VK4 269 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tcf7l2Q924A0 459 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Plod1Q9R0E2 728 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Col5a2Q3U962 1497 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prrg1A2BFE8 218 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hcn2O88703 863 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 FlgP11088 336 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gsta3P30115 221 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Crhr1P35347 415 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 SqleP52019 572 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itga11P61622 1188 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mfsd14aP70187 490 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 FdxrQ61578 494 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm5414Q6IFZ8 552 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem169Q8BG50 297 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc71Q9D3W5 558 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Armc1Q9D7A8 282 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 DmgdhQ9DBT9 869 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Twsg1Q9EP52 222 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sbno2Q7TNB8 1349 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Oip5A2AQ14 241 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itpripl1A2ASA8 547 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rnf217D3YYI7 515 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il27raO70394 623 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ces1cP23953 554 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Guca1aP43081 202 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppp3caP63328 521 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf746Q3U133 652 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Opa3Q505D7 179 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Krt42Q6IFX2 452 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Klhdc10Q6PAR0 439 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam107aQ78TU8 144 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Usp6nlQ80XC3 819 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rhpn2Q8BWR8 686 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc15a5Q8CBB2 566 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Txndc5Q91W90 417 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ndufb5Q9CQH3 189 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 RhouQ9EQT3 261 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stk4Q9JI11 487 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Spint1Q9R097 507 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Apobec2Q9WV35 224 aa7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Iqca1lA6H690 825 aa7.23□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3248K7N721 186 aa7.23□□□□□ -1.25
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mup13L7N222 235 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms