RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mef2dQ63943 514 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myo6Q64331 1265 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sec23ipQ6NZC7 998 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1105Q7TR58 312 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fnip2Q80TD3 1108 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Daam2Q80U19 1115 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q80WR5 230 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdk1Q8BFP9 434 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stx16Q8BVI5 326 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Iffo1Q8BXL9 562 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ClmnQ8C5W0 1052 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spata16Q8C636 571 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh2d5Q8JZW5 429 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MiosQ8VE19 875 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EdaraddQ8VHX2 208 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tti1Q91V83 1085 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Twf1Q91YR1 350 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PigxQ99LV7 254 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Golga1Q9CW79 758 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcaf6Q9DC22 876 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rassf7Q9DD19 359 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PrelpQ9JK53 378 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajb7Q9QYI8 312 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf4Q9QZS2 194 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plod1Q9R0E2 728 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Epm2aQ9WUA5 330 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Map3k14Q9WUL6 942 aa9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PcntP48725 2898 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tubb1A2AQ07 451 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5415E9PXF3 478 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8369E9PZI3 166 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 XntrpcF8VQM8 1264 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arfip1G5E8V9 373 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oas1aP11928 367 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aldh1a1P24549 501 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AmhP27106 555 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Msh2P43247 935 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc11a2P49282 568 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MagohP61327 146 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 YwhahP68510 246 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdh9P70407 786 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IhhP97812 411 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gabpb1Q00420 383 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adcy6Q01341 1165 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gsdmc4Q3TR54 480 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Brms1lQ3U1T3 323 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r7Q3UM45 361 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psg28Q4KL66 472 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vps41Q5KU39 853 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cldn11Q60771 207 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtprjQ64455 1238 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tpp2Q64514 1262 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc154Q6RUT8 657 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prl3a1Q78Y73 227 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r125Q7M710 311 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 WtipQ7TQJ8 398 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Got1l1Q7TSV6 404 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ip6k2Q80V72 448 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chn2Q80XD1 332 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam177a1Q8BR63 207 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr20Q8BYC4 358 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam78aQ8C552 283 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gsdmc3Q8CB12 480 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fcho1Q8K285 873 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oas1gQ8K469 367 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc35f5Q8R314 524 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1502Q8VG66 316 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cog2Q921L5 731 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q922M7 232 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stard13Q923Q2 1113 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc12a6Q924N4 1150 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MagohbQ9CQL1 146 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psma8Q9CWH6 250 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q9D454 513 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcg8Q9DBM0 673 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oxct2bQ9ESL0 520 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vwa7Q9JHA8 891 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oxct2aQ9JJN4 520 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kifc1Q9QWT9 674 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms