RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639605.1

SPIN3-225, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,331 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-225	ENST00000639605	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605		H3BRJ5	948 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	IL1B	P01584	269 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	NEFH	P12036	1026 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ADORA2A	P29274	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	CCNF	P41002	786 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	RGS7	P49802	495 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SNX16	P57768	344 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	EBF4	Q9BQW3	602 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SCN1A	P35498	2009 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	KLF11	O14901	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	GABBR2	O75899	941 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	TOMM70	O94826	608 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	METTL18	O95568	372 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	APRT	P07741	180 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	GSTA2	P09210	222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	DES	P17661	470 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PRKCH	P24723	683 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	VHL	P40337	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	GRM5	P41594	1212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	APBB2	Q92870	758 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ZNF778	Q96MU6	729 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	MDM4	O15151	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	CAPN15	O75808	1086 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	GSR	P00390	522 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	GMPR	P36959	345 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-225	ENST00000639605	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	MEI4	A8MW99	385 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	TSPAN1	O60635	241 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	KRT81	Q14533	505 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-225	ENST00000639605	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22

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