RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625364.1

PPA1-206, Transcript of pyrophosphatase (inorganic) 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PPA1, Length 644 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPA1-206	ENST00000625364	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	HNF1B	P35680	557 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PGF	P49763	221 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CDH8	P55286	799 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SEMG2	Q02383	582 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ENPP2	Q13822	863 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	USP49	Q70CQ1	688 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SV2B	Q7L1I2	683 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	UCMA	Q8WVF2	138 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	IGSF8	Q969P0	613 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	EPSTI1	Q96J88	318 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	KRT82	Q9NSB4	513 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	FBXO10	Q9UK96	956 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PTPN13	Q12923	2485 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	MYLK	Q15746	1914 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	TNNI1	P19237	187 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	GRIA4	P48058	902 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	COPA	P53621	1224 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	MFAP3	P55082	362 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ORC1	Q13415	861 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	GEN1	Q17RS7	908 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	LAYN	Q6UX15	382 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CGRRF1	Q99675	332 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CYLD	Q9NQC7	956 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364		H0Y8X5	98 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364		J3QKU1	62 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	KCNK3	O14649	394 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	JUP	P14923	745 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PRKCH	P24723	683 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	IL9R	Q01113	521 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	TRPC3	Q13507	836 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ZNF234	Q14588	700 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364		Q6ZNB5	142 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	BAP1	Q92560	729 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	P2RY11	Q96G91	374 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	TNIP3	Q96KP6	325 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PANK4	Q9NVE7	773 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	AK5	Q9Y6K8	562 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	MDM4	O15151	490 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CLSTN1	O94985	981 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	EPHX1	P07099	455 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CLDN6	P56747	220 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	MYL6	P60660	151 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CFHR1	Q03591	330 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	E2F5	Q15329	346 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	FUK	Q8N0W3	1084 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SMO	Q99835	787 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	LHX5	Q9H2C1	402 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CAPN8	A6NHC0	703 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CYP26A1	O43174	497 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	RFPL3	O75679	317 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CCDC130	P13994	396 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	GJB2	P29033	226 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ATIC	P31939	592 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	ACSL1	P33121	698 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	TXLNA	P40222	546 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	CTSK	P43235	329 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PLA2G4A	P47712	749 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	MAP3K7CL	P57077	242 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	PSMD6	Q15008	389 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	FYB2	Q5VWT5	728 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PPA1-206	ENST00000625364	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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